Fue fundado en el año de 1597 por los franciscanos. Durante ese año el alcalde mayor de San Luis dio a Francisco Jocquineque y demás indios tlaxcaltecas 2,500 varas de tierra en cuadro para formar la villa de San Miguel, San Francisquito y La Santísima Trinidad. En 1830, año en que se llevó a cabo el arreglo de los municipios, el barrio ya era conocido con el nombre de “San Miguelito”. En el año 1976-1977 se le hicieron mejoras al jardín.
Una de las mayores atracciones del barrio es la hermosa Iglesia Parroquial, con arquitectura barroca, torres de mampostería bajas y majestuosas, y una estatua en piedra de San Miguel Arcángel. Ésta última no es la original, cuentan las historias que la anterior solía caerse debido a las corrientes de aire, pero no se rompía, en cambio, fue un rayo el que la partió en dos.
Las fiestas patronales del barrio son en septiembre.